Etude de la structure des communautés bactériennes du sédiment et de l'écologie de Vibrio aestuarianus pathogène de l'huître creuse Crassostrea gigas dans deux sites ostréicoles

Depuis plusieurs années, l’ostréiculture française doit faire face à de fortes mortalités qui touchent les juvéniles et parfois les adultes de l’huître creuse Crassostrea gigas. Les études réalisées dans le cadre d’un projet multidisciplinaire (MOREST) ont montré que les mortalités survenaient suite à l’interaction de plusieurs facteurs à savoir, l’état physiologique de l’huître et ses caractéristiques génétiques, des pathogènes parmi lesquels des bactéries du genre Vibrio, et l’environnement dont la température et le sédiment. Le rôle du sédiment a été suggéré du fait de la concomitance entre les mortalités, et l’augmentation des composés toxiques comme l’ammonium et les sulfures dans le sédiment. Par ailleurs, il pouvait constituer un réservoir de vibrions selon des études précédentes. Pour vérifier ces hypothèses les caractéristiques physico-chimiques, la structure des communautés bactériennes ainsi que l’abondance de V. aestuarianus, pathogène de C. gigas ont été déterminées dans les sédiments sous tables et hors tables des sites situés dans l’aber Benoît et en rivière d’Auray pendant 2 années. Ce travail a confirmé l’existence d’un risque sédimentaire par la présence de fortes concentrations d’ammonium et de sulfures dans les sédiments à certaines périodes de l’année ainsi que l’influence des huîtres sur leur intensité. Cependant, l’impact des tables ostréicoles sur ces flux n’est évident que dans l’aber Benoît. Il a mis en évidence une certaine stabilité de la structure et de la diversité des microflores des sédiments au regard des nombreuses influences qu’elles subissent, spécialement dans l’aber Benoît. La microflore des sédiments de la rivière d’Auray semble quant à elle plus dynamique et influencée par les apports extérieurs. Ces résultats prouvent l’importance des caractéristiques liées aux sites dans la réponse des communautés bactériennes face des modifications du milieu. La population de Vibrio est apparue peu diversifiée et peu abondante fluctuant avec la température comme les autres groupes bactériens. Deux espèces pathogènes semblent pourtant faire partie de la communauté dominante des sédiments à savoir V. ordalii et V aestuarianus. L’étude de l’écologie de ce dernier a montré qu’il est présent dans le sédiment pendant les saisons froide et chaude alors que sa détection dans les huîtres est plutôt occasionnelle. Des expérimentations en microcosmes avec la souche 02/041 transformée par un plasmide codant pour la GFP ont montré que cette bactérie pouvait circuler aisément entre le sédiment, l’eau de mer et les huîtres et provoquer des mortalités. Nos résultats mettent ainsi en évidence le rôle du sédiment en tant que réservoir de V. aestuarianus.