Bactéries du sédiment : extraction et distribution sur un estran (baie du Mont-Saint-Michel)

© résumé du Refdoc (Inist-CNRS) :
"Afin d'améliorer l'efficacité d'extraction des bactéries du sédiment, plusieurs méthodes basées sur la dispersion des agrégats et le décrochage des bactéries sont testées. La résine échangeuse d'ions Chelex 100, utilisée avec des ultrasons, se révèle la plus efficace. Le taux de récupération des bactéries par cette méthode, à partir de 2 souches pures incubées dans du sédiment autoclavé, est évalué à 98%. L'utilisation de cette technique montre une variation des densités bactériennes sur les parties haute et moyenne de la zone intertidale au printemps et en hiver, qui n'est pas retrouvée au bas de l'estran. La température à la surface du sédiment, influencée par la durée d'émersion, est un facteur déterminant de la distribution spatiale des abondances bactériennes et de leur fluctuation temporelle. Au printemps, les densités bactériennes sont corrélées à la bathymétrie et au grain moyen du sédiment, ce qui n'est pas le cas en hiver."